1.1 Porucha systému přívodu vzduchu
V celém systému HVAC hraje systém přívodu vzduchu velmi, velmi důležitou roli. Protože systém přívodu vzduchu může účinně zajistit normální provoz výfukového systému, jakmile dojde v laboratoři k jakékoli poruše, musí být laboratorní personál evakuován. Během této doby evakuace může systém přívodu vzduchu zajistit dobrý podtlak pro celou biologickou laboratoř. To poskytne nejen dobré zpracovatelské prostředí pro evakuaci personálu, ale také zajistí, že vnitřní prostředí biologické laboratoře bude relativně stabilní. Pokud však dojde k poruše systému přívodu vzduchu, je snadné způsobit bezpečnostní nehodu při evakuaci personálu.
1.2 Porucha snímače
Senzor je zodpovědný především za přenos signálů v systému HVAC biologických laboratoří. Jakmile senzor selže, způsobí to chyby v přenášených signálech. Tímto způsobem, když systém běží, bude se odchylovat od přednastavených postupů samotného systému. Proto musí stavitelé a konstruktéři v procesu návrhu spolehlivě detekovat výkon a stabilitu senzoru a následně jej uvést do provozu. Ale ve skutečnosti lze charakteristiku odezvy snímače snadno ignorovat. Jakmile je tato charakteristika odezvy ignorována, způsobí to přímo problémy s návrhovou hodnotou výsledku ladění a chyba v přenosu signálu povede k vážnějším nehodám.

1.3 Porucha výfukového systému
V celém systému je porucha odtahového ventilátoru velmi vážná. Je to proto, že ventilační systém laboratoře biologické bezpečnosti musí k provádění odtahu s proměnnou frekvencí používat odtahový ventilátor. Je to proto, že biologické laboratoře často provádějí experimenty s vysokým biologickým rizikem, i když pracují ve dne, není povolen žádný přetlak. Proto jsou konstrukční požadavky na systémy automatického řízení HVAC a HVAC velmi vysoké. Mezi konkrétní podrobnosti patří, že když dojde k selhání převodu frekvence ventilátoru nebo výfukového ventilátoru, systém musí být schopen automaticky přepnout na záložní ventilátor a jeho invertor. Jen tak může být podtlak v celé laboratorní místnosti v dobrém stavu. Ale ve skutečnosti, jakmile má výfukový ventilátor problém, způsobí jeho zastavení a tento druh vypnutí způsobí poruchu celého systému.